Assassin’s Creed III относится к жанру action-adventure с элементами стелс-экшена. События игры происходят в открытом мире, который представлен несколькими локациями. В Assassin’s Creed III представлены города Бостон и Нью-Йорк, а также территория Фронтира. Игра имеет 2 сюжетные линии: присутствуют сюжетная линия в прошлом времени, действие которой разворачивается во второй половине XVIII века и сюжетная линия в настоящем, события которой происходят в 2012 году. Игрок может свободно переключаться между ними. Как и в прошлых частях серии, для перемещения по игровому миру игрок может использовать искусство паркур: можно «зацепиться» за любой выступ, забраться на любую постройку и т. д. В игре есть «точки обзора» — здания или природные возвышенности, забравшись на которые, игрок может выполнить «синхронизацию» — открытие некоторой части карты. После выполнения «синхронизации» игрок может сделать «Прыжок веры» — выдуманный игровой прыжок, который позволяет осуществить быстрый спуск со здания или возвышенности в смягчающую падение среду (стог сена, водное пространство и т. д.). Также в игре присутствуют предметы коллекционирования и случайные события в открытом мире. Помимо передвижения пешком, игровой персонаж может использовать транспортные средства: лошадей, а также боевой корабль для перемещения и выполнения заданий. Система миссий в игре представлена системой, когда выбранное задание выполняется всегда последовательно, отсутствует возможность переключения между миссиями в любой момент, а условием поражения является невыполнение условий миссии или смерть персонажа. Обычно миссии можно пройти 2 способами: «скрытым» — незаметное уничтожение врагов и выполнение целей, и «громким» — вступление в открытый бой с противником или группой противников.
